В 1925 году возле озера Баунт в посёлке Баунт, в месте наибольшего скопления эвенков была открыта эвенкийская школа - интернат. Число учащихся 25 человек из них 13 - дети эвенков. Обучение велось на русском языке, эвенкийский язык преподавался как отдельный предмет. В 1927 году открылись начальные школы в поселках Ципикан и Муя, с количеством детей 30 человек.
Первая начальная школа была построена в 1929 г. в поселке Ауник, находящимся в двух километрах от п.Маловск, а в 1929 г. открылась школа в самом поселке .

В поселке Багдарин в 1929 г. первого ноября открыта школа, которая размещалась в здании бывшей церкви. Переделать ее помогли строители, которые шли на прииск в Ципикан. Первая учительница Апрелкова -Васильева Лидия Николаевна. Первыми учениками стали дети эвенков - девять мальчиков две девочки. На плечи молодой учительницы легла полная ответственность за судьбы учеников. Помогали ей повариха Дуня Занданова, бывшая пастушка хозяев прииска Дубниковых и эвенк Леонтий Лоргоктоев, который был и рабочим и переводчиком.

В 1932 году открывается Багдаринская школа. Школа была семилетней, обучалось 45 детей и работало 4 учителя: Воскобойников М.Г., Левинтас Я.Б., Савин М.С., Залыкеева М. Г. При школе существовал интернат с обслуживающим персоналом 4 человека. Заведовал этой школой Яков Борисович Левинтас. Вот отрывок из его воспоминаний: "Приехал я в Багдарин в конце августа 1931 г на должность заведующего Багдаринской эвенкийской начальной школой после окончания Верхнеудинекого педагогического техникума. Ехал я до Багдарина 28 дней. Через Читу и Романовку. Самолет тогда не летал, а на пути встречалось много препятствий. Реки Малый Амалат и Большой Амалат после обильных дождей вышли из берегов приходилось и вплавь, и на лошадях переправляться через них. Но как бы то ни было, мы не падали духом. И вот на 28-й день я прибыл к месту работы. Утром я узнал, что школы- то еще нет. Она строилась, не было ни окон, ни дверей. И вот пришлось, вместо занятий с учащимися, достраивать школу. Только в конце сентября школа была готова. Она была рассчитана на 4 классные комнаты, 2 спальни для детей, столовую, кухню, и комнату для заведующего школой.
А потом поехал собирать детей по тайге. Тогда эвенки вели кочевой образ жизни. Жили они родами. Вот я собрал ребят, остриг их под машинку, так как они обросли, хоть косы заплетай мальчикам, одел во все новое и положил спать, уютные спальни на чистую постель которую они в жизни не видели. Потом они как посмотрят на себя в зеркало - и узнать не могут. Школу тогда построили в стороне поселка в направлении к п.Маловск, а гам где сейчас школа, была тайга, тогда еще только проектировалось основание районного центра около Белой горы..."
Вместе с Яковом Борисовичем работал Эллисов Лазарь Ефимович - имеющий девятилетнее образование, в дальнейшем - доктор филологических наук. Заведующим районо был Борис Михайлович Юрьев. При нем закладывалась средняя школа под Белой горой. Это он готовил чертежи новой школы.

40-е годы, война. Впервые дни войны ушли на фронт учителя Тонких И.С. Медведев Л.Ф., а вместе с ними старшеклассники Кузнецов И., Дектярь М., Клочков , Онищук П., Ожигова Мария, Белькова Мария и др. Многие не вернулись с войны. А школа продолжала жить, учить ребятишек под руководством директора Шанявского и завуча Павловой А.П.
С учителями Убивой Ф.В, Колмаковой О.А, Крошкиной Л.Н. Бураевым В.Н и другими ученики не только учились, но и трудились на уборки урожая, заготовляли корм для скота, пилили, кололи дрова для школы, собирали тёплые вещи для фронта. В1944 г пришёл работать в школу Георгий Дмитриевич Соловьёв, а в 1945 г - Жукова Елизавета Николаевна, которая проработала в школе более, 35 лет, научив читать и писать сотни ребят.

В 50 - е годы в школу влилась молодая волна педагогов, и обучалось уже свыше четырехсот учащихся.
Коллектив учителей заражал своей преданностью и любовью к профессии, многие выпускники впоследствии стали педагогами. Только среди выпускников 1951 г. учителями русского языка и литературы стали 5 человек. Среди выпускников школы тех лет есть прекрасные рабочие врачи, геологи, военные, лётчики...

К 60 - м годам в школе сформировался стабильный педагогический коллектив, сильный и целеустремлённый. Под руководством Хаиль Самуиловича Калекина, тогдашнего директора, крепла материальная база школы.
Молоденькой учительницей пришла в эти годы работать в школу Баракина Евгения Андриановна. Тепло вспоминает она эти годы, школьные традиции: авторские песни, посадки деревьев, костры на Белой горе.
Первые её ученики - Владимир Росов, стал археологом, Гоня Калашникова - певица, работает на Дальнем Востоке, Мангатаева Лена - кандидат математических наук.

Школа 70-х годов - это школа Красноярова Фёдора Ивановича. Заслуги его перед школой огромны. Его деловыми качествами восхищаются до сих пор и учителя и ученики. Фёдор Иванович знал по имени любого ученика с 1-го по 10-й класс. О его требовательности ходят легенды. Это благодаря ему нынешние выпуски получают профессию водителя. Автокласс при школе начал создавать Ф.И. Краснояров, при нём построено и новое здание начальной школы.
Макеева Любовь Андреевна - это тоже легенда нашей школы, сначала завуч, потом директор. С утра до вечера в школе, для неё не было второстепенных вопросов все важное. Её по праву называют "Наш главный учитель".

Нельзя не вспомнить и Виктора Ивановича Самсонова - директора с 1988 по 1993 г., Казулину Валентину Евгеньевну - завуча школы, девизом их отношений к делу было "не стоять на месте, чтобы хорошо учить, нужно постоянно учить самому". 1994 году директор школы Михайлов Андрей Владимирович. После, директором БСШ была Сергеева Нина Саидовна - учитель математики, очень требовательный, но справедливый, отзывчивый человек.

Багдаринская средняя школа - школа с 79 - летней историей. Это более 2 тысяч выпускников. В 2003 г. открылась новая школа на 422 места. Сегодня в школе обучается 733 человека, работает 68 учителей, 42 - обслуживающий персонал.